פתיחת מסתורין של חיידקים בגרורות סרטן

חוקרים במכון הסרטן של הולנד ערכו קטלוג מפורט של חיידקים החיים בגרורות סרטניות. לאחר שניתחו למעלה מ-4000 גידולים, הם שופכים אור על המגוון של תושבים משותפים אלה וכיצד הם עשויים לקיים אינטראקציה עם תאים סרטניים וסביבתם. לדוגמה, חיידקים מסוימים נקשרו לתגובה גרועה יותר לאימונותרפיה. מחקר זה סולל את דרך להבנה טובה יותר של כיצד חיידקים עוזרים או מעכבים סרטן (טיפול), וכיצד נוכל להשתמש בכך לטובת המטופלים. החוקרים לפרסם את ממצאיהם היום בכתב העת המדעי תָא.

על ובגופנו חיים מיליארדי מיקרואורגניזמים: חיידקים, וירוסים ושמרים – המיקרוביום שלנו. אנחנו צריכים אותם, והם צריכים אותנו. חיידקים עוזרים לנו למשל לעכל את המזון שלנו ומשתפים פעולה עם מערכת החיסון שלנו במאבק בפתוגנים. חיידקי מעיים במיוחד נחקרו בהרחבה, כולל בהקשר של סרטן. לדוגמה, הם יכולים להשפיע על היעילות של אימונותרפיה וכימותרפיה.

חיידקים בגרורות

אבל השותפים הזעירים האלה מתגוררים גם מחוץ לבטן. חיידקים נמצאים בגידולים, למשל. עם טכניקות חדשות, החוקרים משתפרים בלגלות אילו חיידקים הם. אבל איך חיידקים מגיעים לגידול ומה בדיוק הם עושים שם עדיין לא ידוע, מה שהופך את זה לא ברור עד כמה הם חשובים למחלה ולהשפעת הטיפולים.

26 סוגי סרטן

מכיוון שחולים רבים מתים בסופו של דבר מגרורות, וטיפולים רבים מכוונים אליהם, קבוצות המחקר של אמיל ווסט ולודוויק ווסלס בחנו מקרוב את הגרורות הללו. אחרי הכל, מעט היה ידוע על חיידקים בגידולים אלה. יחד עם עמיתיהם, בין היתר, במכון הסרטן של הולנד ובמכון Oncode הם מיפו כעת אילו חיידקים קיימים בגרורות סרטניות. שתי הקבוצות כן

ברקמה מיותר מ-4,000 גרורות של 26 סוגי סרטן, החוקרים ניתחו את הקוד של DNA מתנה. מהחומר הגנטי הזה אתה יכול לראות לא רק אילו תאים אנושיים נמצאים שם, אלא גם אילו חיידקים – כי לאלו יש גם DNA. למטרה זו, הם השתמשו במידע קליני ובנתוני DNA שנוצרו על ידי הקרן הרפואית של Hartwig.

ניתוח נתונים וממצאים

עם ההר הגדול הבלתי נתפס הזה של מידע (400 טרה-בייט), הם השתמשו בכוח המחשב כדי להבין אילו חיידקים מתאספים באיזה מקומות (ראה איור). זה דרש הרבה תכנות חכם, מכיוון שיש מעט יחסית DNA חיידקי בפיסת רקמה כזו.

"למרבה ההפתעה, לא רק גרורות מסרטן המעי הגס מכילות הרבה חיידקים", אומר החוקר תומס בטגליה. אפשר לצפות לזה מכיוון שרוב החיידקים שלנו שוכנים במעי הגס, משם הם יכולים אולי לנסוע במהלך הגרורות למקום אחר בגוף. "כמו כן, אילו חיידקים נמצאים בגרורה קשורים מאוד למיקום בגוף, לתנאים שם ולסוג הסרטן."

חיידקים ויעילות טיפול

הם גם גילו קשר בין חיידקים ליעילות הטיפול. חולים עם סרטן ריאות ו Fusobacterium בגרורות שלהם, למשל, הגיבו גרוע יותר לאימונותרפיה מאשר בני גילם ללא החיידק הזה. תומס: "ציינו גם שככל שקהילת החיידקים מגוונת יותר, כך תאי הגידול הסמוכים פעילים יותר."

"העבודה שלנו פותחת דלתות לחקר צורות חדשות של טיפולים, למשל נגד חיידקים שעשויים לעזור לגידול", אומרת שותפה לכותבת איריס מיפן. "זה עוזר לנו להבין כיצד פועלת הסביבה המורכבת של גידולים, סביבה שבה כל מיני תאים – כולל חיידקים – חיים יחד ומשפיעים זה על זה".

מחקר זה נתמך כספית על ידי קרן AVL, האגודה ההולנדית לסרטן KWF ומכון Oncode.